Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACTG1P63261 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms