Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS29P62273 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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