Protein–RNA interactions for Protein: P59998

ARPC4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4P59998 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARPC4P59998 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.1 ms