Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms