Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN12P56749 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms