Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSWP56202 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSWP56202 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSWP56202 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSWP56202 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSWP56202 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSWP56202 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSWP56202 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSWP56202 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSWP56202 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSWP56202 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSWP56202 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSWP56202 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSWP56202 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSWP56202 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSWP56202 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSWP56202 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSWP56202 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSWP56202 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSWP56202 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSWP56202 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSWP56202 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSWP56202 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSWP56202 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSWP56202 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSWP56202 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSWP56202 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSWP56202 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSWP56202 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSWP56202 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSWP56202 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSWP56202 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSWP56202 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSWP56202 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSWP56202 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSWP56202 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSWP56202 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSWP56202 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSWP56202 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSWP56202 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSWP56202 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSWP56202 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSWP56202 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSWP56202 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSWP56202 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSWP56202 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSWP56202 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSWP56202 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSWP56202 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSWP56202 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSWP56202 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSWP56202 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms