Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GFRA1P56159 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms