Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASP9P55211 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASP9P55211 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASP9P55211 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP9P55211 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP9P55211 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP9P55211 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP9P55211 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP9P55211 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP9P55211 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP9P55211 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP9P55211 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP9P55211 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CASP9P55211 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASP9P55211 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms