Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFIP2P53365 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFIP2P53365 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms