Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2A1P52655 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2A1P52655 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms