Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGDP52209 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGDP52209 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGDP52209 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGDP52209 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PGDP52209 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGDP52209 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGDP52209 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGDP52209 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGDP52209 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGDP52209 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGDP52209 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGDP52209 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGDP52209 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGDP52209 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGDP52209 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms