Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLCNKBP51801 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CLCNKBP51801 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms