Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRE11P49959 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRE11P49959 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRE11P49959 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRE11P49959 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRE11P49959 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRE11P49959 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRE11P49959 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRE11P49959 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRE11P49959 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MRE11P49959 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MRE11P49959 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRE11P49959 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRE11P49959 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRE11P49959 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRE11P49959 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRE11P49959 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MRE11P49959 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRE11P49959 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRE11P49959 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms