Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CSNK1A1P48729 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms