Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CAPZBP47756 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms