Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP5P45974 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP5P45974 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP5P45974 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP5P45974 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP5P45974 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP5P45974 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP5P45974 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP5P45974 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP5P45974 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP5P45974 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP5P45974 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP5P45974 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP5P45974 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP5P45974 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP5P45974 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP5P45974 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP5P45974 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP5P45974 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP5P45974 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP5P45974 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP5P45974 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP5P45974 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP5P45974 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP5P45974 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP5P45974 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP5P45974 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP5P45974 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP5P45974 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP5P45974 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP5P45974 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP5P45974 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP5P45974 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP5P45974 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms