Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPOP42166 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPOP42166 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPOP42166 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPOP42166 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPOP42166 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPOP42166 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPOP42166 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMPOP42166 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMPOP42166 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPOP42166 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPOP42166 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPOP42166 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPOP42166 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPOP42166 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPOP42166 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPOP42166 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPOP42166 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPOP42166 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPOP42166 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPOP42166 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPOP42166 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPOP42166 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPOP42166 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPOP42166 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMPOP42166 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMPOP42166 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMPOP42166 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMPOP42166 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPOP42166 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPOP42166 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPOP42166 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPOP42166 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPOP42166 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPOP42166 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPOP42166 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPOP42166 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPOP42166 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPOP42166 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPOP42166 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPOP42166 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMPOP42166 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPOP42166 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPOP42166 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPOP42166 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPOP42166 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPOP42166 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPOP42166 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPOP42166 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPOP42166 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPOP42166 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPOP42166 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPOP42166 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPOP42166 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPOP42166 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPOP42166 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPOP42166 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMPOP42166 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMPOP42166 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms