Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNCAP37840 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNCAP37840 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNCAP37840 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNCAP37840 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNCAP37840 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNCAP37840 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms