Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GJC1P36383 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJC1P36383 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJC1P36383 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJC1P36383 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GJC1P36383 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJC1P36383 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJC1P36383 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJC1P36383 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJC1P36383 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJC1P36383 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJC1P36383 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GJC1P36383 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GJC1P36383 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GJC1P36383 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GJC1P36383 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJC1P36383 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJC1P36383 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GJC1P36383 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms