Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ABCC1P33527 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ABCC1P33527 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms