Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GBP1P32455 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GBP1P32455 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GBP1P32455 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBP1P32455 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP1P32455 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP1P32455 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP1P32455 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP1P32455 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP1P32455 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP1P32455 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP1P32455 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP1P32455 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GBP1P32455 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms