Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRS3P32247 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRS3P32247 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRS3P32247 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms