Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCKARP32238 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCKARP32238 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKARP32238 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKARP32238 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKARP32238 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKARP32238 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKARP32238 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKARP32238 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKARP32238 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKARP32238 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKARP32238 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKARP32238 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKARP32238 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKARP32238 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKARP32238 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCKARP32238 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCKARP32238 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCKARP32238 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms