Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID4AP29374 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms