Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP1P28562 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUSP1P28562 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms