Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD27P26842 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD27P26842 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD27P26842 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD27P26842 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD27P26842 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD27P26842 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD27P26842 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD27P26842 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD27P26842 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD27P26842 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD27P26842 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD27P26842 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CD27P26842 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD27P26842 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms