Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTX3P26022 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTX3P26022 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTX3P26022 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTX3P26022 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms