Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CXCR1P25024 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms