Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPREP23469 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPREP23469 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPREP23469 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPREP23469 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPREP23469 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPREP23469 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPREP23469 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPREP23469 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPREP23469 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPREP23469 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPREP23469 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPREP23469 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPREP23469 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPREP23469 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPREP23469 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPREP23469 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPREP23469 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPREP23469 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPREP23469 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPREP23469 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPREP23469 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPREP23469 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPREP23469 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPREP23469 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPREP23469 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPREP23469 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPREP23469 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPREP23469 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPREP23469 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPREP23469 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPREP23469 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPREP23469 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPREP23469 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPREP23469 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPREP23469 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPREP23469 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPREP23469 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPREP23469 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPREP23469 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPREP23469 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPREP23469 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPREP23469 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPREP23469 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPREP23469 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPREP23469 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPREP23469 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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