Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRDP23468 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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