Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HNF1AP20823 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms