Protein–RNA interactions for Protein: P18827

SDC1, Syndecan-1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC1P18827 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDC1P18827 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SDC1P18827 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDC1P18827 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDC1P18827 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDC1P18827 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SDC1P18827 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDC1P18827 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDC1P18827 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDC1P18827 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDC1P18827 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDC1P18827 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDC1P18827 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDC1P18827 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SDC1P18827 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SDC1P18827 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SDC1P18827 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SDC1P18827 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms