Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SPI1P17947 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SPI1P17947 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPI1P17947 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPI1P17947 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms