Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOXB9P17482 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXB9P17482 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms