Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VAV1P15498 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAV1P15498 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAV1P15498 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAV1P15498 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAV1P15498 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAV1P15498 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VAV1P15498 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAV1P15498 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VAV1P15498 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAV1P15498 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAV1P15498 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VAV1P15498 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VAV1P15498 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VAV1P15498 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VAV1P15498 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VAV1P15498 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAV1P15498 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAV1P15498 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAV1P15498 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms