Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXB3P14651 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXB3P14651 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms