Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SMIM10L2BP0DMW5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMIM10L2BP0DMW5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms