Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPM2P07951 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TPM2P07951 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPM2P07951 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPM2P07951 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPM2P07951 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPM2P07951 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPM2P07951 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPM2P07951 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPM2P07951 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPM2P07951 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPM2P07951 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPM2P07951 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TPM2P07951 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TPM2P07951 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPM2P07951 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPM2P07951 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPM2P07951 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPM2P07951 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPM2P07951 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms