Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGAVP06756 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms