Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APOC3P02656 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOC3P02656 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC3P02656 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC3P02656 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC3P02656 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC3P02656 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC3P02656 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC3P02656 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC3P02656 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms