Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D2O95562 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms