Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABCB11O95342 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABCB11O95342 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms