Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG12O94817 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG12O94817 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG12O94817 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG12O94817 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG12O94817 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG12O94817 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG12O94817 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG12O94817 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG12O94817 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG12O94817 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG12O94817 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG12O94817 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG12O94817 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG12O94817 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG12O94817 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG12O94817 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG12O94817 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms