Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VAMP4O75379 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms