Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGSF3O75054 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGSF3O75054 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms