Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRD4O60885 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
BRD4O60885 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRD4O60885 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRD4O60885 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRD4O60885 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRD4O60885 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRD4O60885 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRD4O60885 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRD4O60885 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRD4O60885 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRD4O60885 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRD4O60885 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRD4O60885 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRD4O60885 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRD4O60885 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRD4O60885 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRD4O60885 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD4O60885 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD4O60885 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD4O60885 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD4O60885 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD4O60885 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD4O60885 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD4O60885 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD4O60885 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD4O60885 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD4O60885 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD4O60885 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRD4O60885 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BRD4O60885 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRD4O60885 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms