Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOX15O60248 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOX15O60248 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOX15O60248 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms