Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYNGR3O43761 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms