Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPRY3O43610 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms