Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HTRA2O43464 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms